MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 57007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010321	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010321	TAT	2	6	17	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010321	TAAA	2	8	33	40	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010321	AGG	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010321	ATC	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
6	NC_010321	CCA	2	6	143	148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
7	NC_010321	ACA	2	6	152	157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036432
8	NC_010321	ATT	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036432
9	NC_010321	GAT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036432
10	NC_010321	A	6	6	231	236	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
11	NC_010321	TAA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
12	NC_010321	AT	3	6	252	257	50 %	50 %	0 %	0 %	167036432
13	NC_010321	ACG	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
14	NC_010321	AAAT	2	8	291	298	75 %	25 %	0 %	0 %	167036432
15	NC_010321	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
16	NC_010321	GAA	3	9	328	336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
17	NC_010321	ACT	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
18	NC_010321	TTTA	2	8	507	514	25 %	75 %	0 %	0 %	167036432
19	NC_010321	GGA	2	6	520	525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036432
20	NC_010321	ATGC	2	8	550	557	25 %	25 %	25 %	25 %	167036432
21	NC_010321	TACGT	2	10	604	613	20 %	40 %	20 %	20 %	167036432
22	NC_010321	AGTT	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	167036432
23	NC_010321	GAC	2	6	652	657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
24	NC_010321	GAA	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
25	NC_010321	TTC	2	6	698	703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036432
26	NC_010321	GAT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036432
27	NC_010321	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
28	NC_010321	GAAC	2	8	736	743	50 %	0 %	25 %	25 %	167036432
29	NC_010321	AAG	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
30	NC_010321	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036432
31	NC_010321	ACC	2	6	816	821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
32	NC_010321	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
33	NC_010321	CCA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
34	NC_010321	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
35	NC_010321	A	6	6	986	991	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
36	NC_010321	TCAA	2	8	993	1000	50 %	25 %	0 %	25 %	167036432
37	NC_010321	AG	3	6	1006	1011	50 %	0 %	50 %	0 %	167036432
38	NC_010321	TAA	2	6	1025	1030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
39	NC_010321	TAA	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
40	NC_010321	GA	3	6	1119	1124	50 %	0 %	50 %	0 %	167036432
41	NC_010321	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
42	NC_010321	AGA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
43	NC_010321	A	6	6	1206	1211	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
44	NC_010321	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
45	NC_010321	TAC	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
46	NC_010321	A	6	6	1328	1333	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
47	NC_010321	TC	3	6	1362	1367	0 %	50 %	0 %	50 %	167036432
48	NC_010321	T	6	6	1449	1454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010321	TAA	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010321	ATT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010321	TCT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010321	ACT	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010321	CTTAT	2	10	1584	1593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010321	TAT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010321	A	7	7	1613	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010321	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	167036433
57	NC_010321	TG	4	8	1654	1661	0 %	50 %	50 %	0 %	167036433
58	NC_010321	ATT	2	6	1672	1677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
59	NC_010321	G	6	6	1701	1706	0 %	0 %	100 %	0 %	167036433
60	NC_010321	ACT	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036433
61	NC_010321	TTC	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036433
62	NC_010321	GTCAA	2	10	1764	1773	40 %	20 %	20 %	20 %	167036433
63	NC_010321	AGA	3	9	1828	1836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
64	NC_010321	TAG	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036433
65	NC_010321	TAA	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
66	NC_010321	TA	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	167036433
67	NC_010321	AGA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
68	NC_010321	AGAGAT	2	12	2293	2304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036433
69	NC_010321	GAAG	2	8	2369	2376	50 %	0 %	50 %	0 %	167036433
70	NC_010321	AAT	2	6	2489	2494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
71	NC_010321	TTA	2	6	2523	2528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
72	NC_010321	TCT	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036433
73	NC_010321	GAT	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036433
74	NC_010321	A	6	6	2565	2570	100 %	0 %	0 %	0 %	167036433
75	NC_010321	TTA	2	6	2624	2629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
76	NC_010321	GAA	3	9	2651	2659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
77	NC_010321	TAA	3	9	2694	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
78	NC_010321	T	6	6	2771	2776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010321	AT	3	6	2805	2810	50 %	50 %	0 %	0 %	167036434
80	NC_010321	GGA	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036434
81	NC_010321	AAGCA	2	10	2861	2870	60 %	0 %	20 %	20 %	167036434
82	NC_010321	ATTT	2	8	2871	2878	25 %	75 %	0 %	0 %	167036434
83	NC_010321	A	6	6	2926	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	167036434
84	NC_010321	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
85	NC_010321	AATA	2	8	3067	3074	75 %	25 %	0 %	0 %	167036435
86	NC_010321	TTA	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
87	NC_010321	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
88	NC_010321	ATT	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
89	NC_010321	AAT	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
90	NC_010321	A	7	7	3236	3242	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
91	NC_010321	AATAA	2	10	3293	3302	80 %	20 %	0 %	0 %	167036435
92	NC_010321	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	167036435
93	NC_010321	ATA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
94	NC_010321	AAG	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036435
95	NC_010321	TGT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036435
96	NC_010321	AAAAGT	2	12	3509	3520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036435
97	NC_010321	TGA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
98	NC_010321	TAG	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
99	NC_010321	TGA	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
100	NC_010321	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
101	NC_010321	A	6	6	3592	3597	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
102	NC_010321	A	7	7	3613	3619	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
103	NC_010321	CAG	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036435
104	NC_010321	GAA	2	6	3695	3700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036435
105	NC_010321	A	7	7	3707	3713	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
106	NC_010321	ACA	2	6	3764	3769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036435
107	NC_010321	ATT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
108	NC_010321	TTC	2	6	3832	3837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036435
109	NC_010321	A	6	6	3895	3900	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
110	NC_010321	A	7	7	3964	3970	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
111	NC_010321	TAC	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036435
112	NC_010321	GTT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036435
113	NC_010321	A	6	6	4091	4096	100 %	0 %	0 %	0 %	167036436
114	NC_010321	GGC	2	6	4111	4116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036436
115	NC_010321	ACT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036436
116	NC_010321	GAA	3	9	4210	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036436
117	NC_010321	TAT	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036436
118	NC_010321	TTAT	3	12	4289	4300	25 %	75 %	0 %	0 %	167036436
119	NC_010321	AAG	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036436
120	NC_010321	A	6	6	4337	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	167036436
121	NC_010321	A	6	6	4373	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	167036437
122	NC_010321	TTG	2	6	4391	4396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036437
123	NC_010321	AAG	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
124	NC_010321	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
125	NC_010321	A	6	6	4475	4480	100 %	0 %	0 %	0 %	167036437
126	NC_010321	GAAAG	2	10	4501	4510	60 %	0 %	40 %	0 %	167036437
127	NC_010321	AAGAA	2	10	4536	4545	80 %	0 %	20 %	0 %	167036437
128	NC_010321	ATAA	2	8	4588	4595	75 %	25 %	0 %	0 %	167036437
129	NC_010321	TAAT	2	8	4637	4644	50 %	50 %	0 %	0 %	167036437
130	NC_010321	GGA	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036437
131	NC_010321	AGA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
132	NC_010321	A	6	6	4753	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	167036437
133	NC_010321	T	6	6	4839	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	167036437
134	NC_010321	T	7	7	4902	4908	0 %	100 %	0 %	0 %	167036437
135	NC_010321	TAT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
136	NC_010321	ATT	2	6	4967	4972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
137	NC_010321	TTTA	2	8	4975	4982	25 %	75 %	0 %	0 %	167036437
138	NC_010321	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036437
139	NC_010321	AG	4	8	5097	5104	50 %	0 %	50 %	0 %	167036437
140	NC_010321	AT	3	6	5155	5160	50 %	50 %	0 %	0 %	167036437
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145	NC_010321	AAG	3	9	5420	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
146	NC_010321	TGG	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036437
147	NC_010321	ATGA	2	8	5497	5504	50 %	25 %	25 %	0 %	167036437
148	NC_010321	CTA	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036437
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151	NC_010321	TATGGC	2	12	5613	5624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167036437
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161	NC_010321	A	6	6	6164	6169	100 %	0 %	0 %	0 %	167036437
162	NC_010321	ACTGG	2	10	6206	6215	20 %	20 %	40 %	20 %	167036437
163	NC_010321	TAT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
164	NC_010321	ATA	2	6	6265	6270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036437
165	NC_010321	AGG	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036437
166	NC_010321	ATT	2	6	6297	6302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
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172	NC_010321	T	7	7	6645	6651	0 %	100 %	0 %	0 %	167036438
173	NC_010321	TTG	2	6	6681	6686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036438
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185	NC_010321	TATATC	2	12	7212	7223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167036438
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200	NC_010321	T	6	6	7766	7771	0 %	100 %	0 %	0 %	167036439
201	NC_010321	T	6	6	7773	7778	0 %	100 %	0 %	0 %	167036439
202	NC_010321	T	6	6	7786	7791	0 %	100 %	0 %	0 %	167036439
203	NC_010321	CTTC	2	8	7797	7804	0 %	50 %	0 %	50 %	167036439
204	NC_010321	CAA	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036439
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209	NC_010321	TAG	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036439
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211	NC_010321	AT	3	6	8063	8068	50 %	50 %	0 %	0 %	167036439
212	NC_010321	TCT	2	6	8069	8074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036439
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220	NC_010321	GTTA	2	8	8324	8331	25 %	50 %	25 %	0 %	167036439
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223	NC_010321	TTA	2	6	8410	8415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
224	NC_010321	A	6	6	8424	8429	100 %	0 %	0 %	0 %	167036439
225	NC_010321	T	6	6	8436	8441	0 %	100 %	0 %	0 %	167036439
226	NC_010321	AGT	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036439
227	NC_010321	CTT	2	6	8479	8484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036439
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230	NC_010321	TTA	3	9	8566	8574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
231	NC_010321	TAT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036439
232	NC_010321	T	6	6	8604	8609	0 %	100 %	0 %	0 %	167036439
233	NC_010321	AT	3	6	8683	8688	50 %	50 %	0 %	0 %	167036439
234	NC_010321	ACC	2	6	8731	8736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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239	NC_010321	T	6	6	8871	8876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_010321	A	6	6	8877	8882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_010321	TATAT	2	10	8920	8929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_010321	TATAT	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_010321	AAT	2	6	9005	9010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_010321	ATTTT	2	10	9023	9032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_010321	ATAAA	2	10	9058	9067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_010321	CAAATA	2	12	9129	9140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167036441
247	NC_010321	TA	3	6	9180	9185	50 %	50 %	0 %	0 %	167036441
248	NC_010321	CAT	2	6	9210	9215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036441
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250	NC_010321	TAG	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036441
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259	NC_010321	ATG	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036441
260	NC_010321	GA	3	6	9671	9676	50 %	0 %	50 %	0 %	167036441
261	NC_010321	TAAA	2	8	9688	9695	75 %	25 %	0 %	0 %	167036441
262	NC_010321	AGA	2	6	9734	9739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036441
263	NC_010321	TCC	2	6	9802	9807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167036441
264	NC_010321	TGCA	2	8	9861	9868	25 %	25 %	25 %	25 %	167036441
265	NC_010321	TAA	2	6	9908	9913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036441
266	NC_010321	GGT	2	6	9930	9935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036441
267	NC_010321	TAG	2	6	9943	9948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036441
268	NC_010321	AGC	2	6	9956	9961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036441
269	NC_010321	A	6	6	10079	10084	100 %	0 %	0 %	0 %	167036441
270	NC_010321	GTA	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036441
271	NC_010321	T	6	6	10175	10180	0 %	100 %	0 %	0 %	167036441
272	NC_010321	AGA	2	6	10181	10186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036441
273	NC_010321	TAG	2	6	10210	10215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036441
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276	NC_010321	AGA	2	6	10275	10280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036441
277	NC_010321	TAC	2	6	10298	10303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036441
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280	NC_010321	AGT	2	6	10571	10576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036441
281	NC_010321	TA	3	6	10696	10701	50 %	50 %	0 %	0 %	167036441
282	NC_010321	TAT	2	6	10725	10730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036441
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390	NC_010321	GTA	2	6	15659	15664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036445
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392	NC_010321	AGC	2	6	15739	15744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036445
393	NC_010321	TGATAC	2	12	15765	15776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167036445
394	NC_010321	AAAG	2	8	15803	15810	75 %	0 %	25 %	0 %	167036445
395	NC_010321	A	7	7	15816	15822	100 %	0 %	0 %	0 %	167036445
396	NC_010321	TCC	2	6	15886	15891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167036445
397	NC_010321	A	6	6	15892	15897	100 %	0 %	0 %	0 %	167036445
398	NC_010321	AAG	2	6	15943	15948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036445
399	NC_010321	AAG	2	6	15957	15962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036445
400	NC_010321	AGG	2	6	16048	16053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036445
401	NC_010321	ACT	2	6	16076	16081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036445
402	NC_010321	TGG	2	6	16132	16137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036445
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404	NC_010321	ATGAA	2	10	16221	16230	60 %	20 %	20 %	0 %	167036445
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498	NC_010321	CTT	2	6	21282	21287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036450
499	NC_010321	TTTAG	2	10	21320	21329	20 %	60 %	20 %	0 %	167036450
500	NC_010321	TGA	2	6	21409	21414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036450

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